Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL1O95922 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL1O95922 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms