Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms