Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms