Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF12O95522 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF12O95522 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF12O95522 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms