Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX6O95503 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX6O95503 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX6O95503 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX6O95503 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX6O95503 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX6O95503 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX6O95503 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX6O95503 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX6O95503 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX6O95503 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX6O95503 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX6O95503 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX6O95503 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX6O95503 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX6O95503 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX6O95503 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX6O95503 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX6O95503 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX6O95503 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX6O95503 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX6O95503 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX6O95503 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX6O95503 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX6O95503 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX6O95503 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX6O95503 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX6O95503 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX6O95503 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX6O95503 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX6O95503 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX6O95503 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX6O95503 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX6O95503 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX6O95503 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX6O95503 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX6O95503 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX6O95503 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX6O95503 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX6O95503 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX6O95503 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX6O95503 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX6O95503 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX6O95503 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX6O95503 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX6O95503 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX6O95503 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX6O95503 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX6O95503 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX6O95503 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms