Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM13AO94988 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM13AO94988 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms