Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms