Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMUO75648 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMUO75648 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMUO75648 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMUO75648 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMUO75648 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMUO75648 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMUO75648 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMUO75648 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMUO75648 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMUO75648 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMUO75648 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMUO75648 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMUO75648 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMUO75648 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMUO75648 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMUO75648 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMUO75648 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMUO75648 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMUO75648 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMUO75648 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMUO75648 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMUO75648 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMUO75648 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMUO75648 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMUO75648 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMUO75648 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMUO75648 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMUO75648 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRMUO75648 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRMUO75648 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRMUO75648 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRMUO75648 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRMUO75648 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRMUO75648 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRMUO75648 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRMUO75648 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRMUO75648 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRMUO75648 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRMUO75648 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMUO75648 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMUO75648 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMUO75648 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMUO75648 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMUO75648 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMUO75648 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMUO75648 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMUO75648 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMUO75648 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMUO75648 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMUO75648 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRMUO75648 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMUO75648 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMUO75648 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMUO75648 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMUO75648 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMUO75648 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMUO75648 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMUO75648 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMUO75648 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMUO75648 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRMUO75648 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRMUO75648 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMUO75648 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMUO75648 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMUO75648 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMUO75648 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMUO75648 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMUO75648 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMUO75648 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMUO75648 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMUO75648 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms