Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRGAP2O75044 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms