Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN2BO60939 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms