Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUTAO60888 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUTAO60888 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUTAO60888 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUTAO60888 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUTAO60888 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUTAO60888 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUTAO60888 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUTAO60888 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUTAO60888 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUTAO60888 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUTAO60888 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUTAO60888 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUTAO60888 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUTAO60888 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUTAO60888 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUTAO60888 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUTAO60888 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUTAO60888 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUTAO60888 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUTAO60888 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUTAO60888 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CUTAO60888 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUTAO60888 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUTAO60888 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CUTAO60888 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUTAO60888 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUTAO60888 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUTAO60888 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUTAO60888 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUTAO60888 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUTAO60888 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CUTAO60888 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUTAO60888 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUTAO60888 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUTAO60888 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUTAO60888 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUTAO60888 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUTAO60888 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUTAO60888 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUTAO60888 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUTAO60888 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUTAO60888 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUTAO60888 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUTAO60888 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUTAO60888 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUTAO60888 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUTAO60888 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUTAO60888 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUTAO60888 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUTAO60888 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUTAO60888 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUTAO60888 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUTAO60888 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUTAO60888 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUTAO60888 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUTAO60888 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUTAO60888 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUTAO60888 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUTAO60888 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUTAO60888 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CUTAO60888 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUTAO60888 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUTAO60888 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUTAO60888 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUTAO60888 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUTAO60888 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUTAO60888 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CUTAO60888 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUTAO60888 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUTAO60888 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUTAO60888 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUTAO60888 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUTAO60888 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUTAO60888 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUTAO60888 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUTAO60888 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUTAO60888 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUTAO60888 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUTAO60888 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUTAO60888 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUTAO60888 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUTAO60888 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUTAO60888 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUTAO60888 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUTAO60888 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUTAO60888 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUTAO60888 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms