Protein–RNA interactions for Protein: O60840

CACNA1F, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, humanhuman

Predictions only

Length 1,977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1FO60840 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA1FO60840 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CACNA1FO60840 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1FO60840 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms