Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF4O60810 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF4O60810 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms