Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATP10AO60312 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATP10AO60312 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ATP10AO60312 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP10AO60312 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP10AO60312 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms