Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAK2O60296 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms