Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
URB1O60287 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
URB1O60287 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
URB1O60287 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
URB1O60287 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
URB1O60287 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
URB1O60287 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URB1O60287 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
URB1O60287 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
URB1O60287 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URB1O60287 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
URB1O60287 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
URB1O60287 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URB1O60287 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URB1O60287 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
URB1O60287 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URB1O60287 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
URB1O60287 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
URB1O60287 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
URB1O60287 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
URB1O60287 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
URB1O60287 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
URB1O60287 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
URB1O60287 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
URB1O60287 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
URB1O60287 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
URB1O60287 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
URB1O60287 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
URB1O60287 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
URB1O60287 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
URB1O60287 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
URB1O60287 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
URB1O60287 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
URB1O60287 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
URB1O60287 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
URB1O60287 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
URB1O60287 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URB1O60287 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URB1O60287 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URB1O60287 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
URB1O60287 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
URB1O60287 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
URB1O60287 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URB1O60287 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URB1O60287 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URB1O60287 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URB1O60287 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
URB1O60287 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
URB1O60287 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
URB1O60287 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
URB1O60287 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
URB1O60287 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
URB1O60287 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
URB1O60287 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
URB1O60287 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
URB1O60287 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
URB1O60287 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
URB1O60287 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
URB1O60287 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
URB1O60287 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
URB1O60287 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
URB1O60287 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
URB1O60287 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
URB1O60287 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
URB1O60287 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
URB1O60287 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
URB1O60287 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
URB1O60287 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
URB1O60287 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
URB1O60287 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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