Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DCXO43602 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCXO43602 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCXO43602 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
DCXO43602 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCXO43602 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DCXO43602 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCXO43602 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCXO43602 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCXO43602 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCXO43602 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCXO43602 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DCXO43602 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DCXO43602 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCXO43602 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCXO43602 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCXO43602 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCXO43602 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCXO43602 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCXO43602 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCXO43602 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCXO43602 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCXO43602 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCXO43602 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCXO43602 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCXO43602 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCXO43602 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCXO43602 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCXO43602 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCXO43602 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCXO43602 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCXO43602 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCXO43602 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCXO43602 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCXO43602 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCXO43602 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCXO43602 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCXO43602 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCXO43602 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCXO43602 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCXO43602 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCXO43602 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCXO43602 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCXO43602 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCXO43602 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DCXO43602 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DCXO43602 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCXO43602 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCXO43602 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCXO43602 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCXO43602 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCXO43602 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCXO43602 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCXO43602 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCXO43602 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCXO43602 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCXO43602 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCXO43602 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCXO43602 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCXO43602 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DCXO43602 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCXO43602 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DCXO43602 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCXO43602 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCXO43602 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms