Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OIP5O43482 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OIP5O43482 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OIP5O43482 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OIP5O43482 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OIP5O43482 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OIP5O43482 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OIP5O43482 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
OIP5O43482 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
OIP5O43482 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OIP5O43482 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OIP5O43482 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OIP5O43482 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OIP5O43482 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OIP5O43482 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OIP5O43482 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OIP5O43482 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OIP5O43482 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OIP5O43482 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OIP5O43482 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OIP5O43482 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OIP5O43482 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OIP5O43482 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OIP5O43482 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OIP5O43482 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OIP5O43482 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
OIP5O43482 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OIP5O43482 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OIP5O43482 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OIP5O43482 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OIP5O43482 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OIP5O43482 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OIP5O43482 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OIP5O43482 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OIP5O43482 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OIP5O43482 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OIP5O43482 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OIP5O43482 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OIP5O43482 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OIP5O43482 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OIP5O43482 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OIP5O43482 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OIP5O43482 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OIP5O43482 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OIP5O43482 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OIP5O43482 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
OIP5O43482 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OIP5O43482 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OIP5O43482 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OIP5O43482 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OIP5O43482 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OIP5O43482 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OIP5O43482 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OIP5O43482 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OIP5O43482 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OIP5O43482 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OIP5O43482 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OIP5O43482 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms