Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EMC8O43402 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMC8O43402 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EMC8O43402 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMC8O43402 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMC8O43402 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMC8O43402 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMC8O43402 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMC8O43402 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMC8O43402 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMC8O43402 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMC8O43402 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMC8O43402 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMC8O43402 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMC8O43402 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMC8O43402 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMC8O43402 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMC8O43402 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMC8O43402 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EMC8O43402 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EMC8O43402 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMC8O43402 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EMC8O43402 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMC8O43402 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMC8O43402 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMC8O43402 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMC8O43402 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMC8O43402 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMC8O43402 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EMC8O43402 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMC8O43402 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMC8O43402 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EMC8O43402 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMC8O43402 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EMC8O43402 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMC8O43402 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC8O43402 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC8O43402 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC8O43402 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC8O43402 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC8O43402 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC8O43402 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC8O43402 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC8O43402 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC8O43402 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC8O43402 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC8O43402 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC8O43402 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC8O43402 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMC8O43402 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMC8O43402 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMC8O43402 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EMC8O43402 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMC8O43402 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EMC8O43402 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMC8O43402 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMC8O43402 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMC8O43402 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMC8O43402 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMC8O43402 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms