Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSI1O43347 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSI1O43347 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSI1O43347 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSI1O43347 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSI1O43347 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSI1O43347 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MSI1O43347 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MSI1O43347 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSI1O43347 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSI1O43347 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSI1O43347 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSI1O43347 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSI1O43347 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSI1O43347 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSI1O43347 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSI1O43347 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI1O43347 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI1O43347 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI1O43347 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI1O43347 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI1O43347 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI1O43347 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI1O43347 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI1O43347 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI1O43347 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI1O43347 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI1O43347 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSI1O43347 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSI1O43347 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSI1O43347 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSI1O43347 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSI1O43347 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSI1O43347 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSI1O43347 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSI1O43347 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSI1O43347 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MSI1O43347 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSI1O43347 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSI1O43347 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MSI1O43347 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MSI1O43347 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSI1O43347 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSI1O43347 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSI1O43347 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MSI1O43347 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSI1O43347 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSI1O43347 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSI1O43347 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI1O43347 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI1O43347 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI1O43347 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI1O43347 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI1O43347 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI1O43347 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI1O43347 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI1O43347 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI1O43347 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI1O43347 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI1O43347 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI1O43347 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSI1O43347 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSI1O43347 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSI1O43347 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSI1O43347 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSI1O43347 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSI1O43347 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSI1O43347 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSI1O43347 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSI1O43347 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSI1O43347 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSI1O43347 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSI1O43347 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSI1O43347 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSI1O43347 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSI1O43347 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI1O43347 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSI1O43347 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSI1O43347 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSI1O43347 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSI1O43347 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSI1O43347 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSI1O43347 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSI1O43347 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSI1O43347 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSI1O43347 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms