Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREHO43280 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREHO43280 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREHO43280 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TREHO43280 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREHO43280 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREHO43280 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TREHO43280 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREHO43280 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREHO43280 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREHO43280 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREHO43280 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREHO43280 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREHO43280 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREHO43280 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREHO43280 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREHO43280 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TREHO43280 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREHO43280 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREHO43280 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREHO43280 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREHO43280 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREHO43280 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREHO43280 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TREHO43280 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TREHO43280 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TREHO43280 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREHO43280 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREHO43280 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREHO43280 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREHO43280 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREHO43280 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREHO43280 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREHO43280 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREHO43280 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TREHO43280 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREHO43280 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREHO43280 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREHO43280 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREHO43280 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREHO43280 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREHO43280 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREHO43280 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREHO43280 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREHO43280 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREHO43280 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREHO43280 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREHO43280 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREHO43280 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREHO43280 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TREHO43280 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TREHO43280 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TREHO43280 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TREHO43280 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TREHO43280 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TREHO43280 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TREHO43280 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TREHO43280 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TREHO43280 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREHO43280 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREHO43280 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREHO43280 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREHO43280 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREHO43280 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TREHO43280 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREHO43280 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREHO43280 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TREHO43280 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TREHO43280 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREHO43280 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREHO43280 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREHO43280 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms