Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA2O43164 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA2O43164 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA2O43164 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PJA2O43164 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PJA2O43164 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PJA2O43164 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PJA2O43164 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PJA2O43164 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PJA2O43164 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA2O43164 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA2O43164 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA2O43164 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA2O43164 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA2O43164 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA2O43164 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA2O43164 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA2O43164 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA2O43164 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA2O43164 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA2O43164 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA2O43164 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA2O43164 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA2O43164 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA2O43164 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA2O43164 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA2O43164 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA2O43164 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA2O43164 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA2O43164 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA2O43164 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA2O43164 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA2O43164 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA2O43164 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA2O43164 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA2O43164 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA2O43164 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA2O43164 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA2O43164 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA2O43164 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA2O43164 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA2O43164 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA2O43164 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PJA2O43164 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PJA2O43164 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PJA2O43164 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PJA2O43164 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PJA2O43164 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PJA2O43164 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PJA2O43164 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PJA2O43164 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PJA2O43164 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PJA2O43164 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PJA2O43164 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PJA2O43164 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PJA2O43164 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PJA2O43164 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA2O43164 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA2O43164 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA2O43164 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA2O43164 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA2O43164 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA2O43164 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA2O43164 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA2O43164 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA2O43164 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA2O43164 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA2O43164 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA2O43164 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA2O43164 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA2O43164 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA2O43164 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA2O43164 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA2O43164 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA2O43164 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA2O43164 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA2O43164 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PJA2O43164 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PJA2O43164 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PJA2O43164 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PJA2O43164 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PJA2O43164 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PJA2O43164 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms