Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP290O15078 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP290O15078 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP290O15078 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP290O15078 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP290O15078 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP290O15078 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP290O15078 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP290O15078 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP290O15078 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP290O15078 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP290O15078 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP290O15078 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP290O15078 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP290O15078 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP290O15078 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP290O15078 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP290O15078 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP290O15078 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP290O15078 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP290O15078 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP290O15078 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP290O15078 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP290O15078 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP290O15078 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP290O15078 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP290O15078 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP290O15078 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP290O15078 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP290O15078 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP290O15078 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP290O15078 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP290O15078 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP290O15078 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP290O15078 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP290O15078 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP290O15078 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP290O15078 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP290O15078 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP290O15078 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP290O15078 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP290O15078 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP290O15078 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP290O15078 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP290O15078 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP290O15078 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP290O15078 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP290O15078 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP290O15078 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP290O15078 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP290O15078 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP290O15078 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP290O15078 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP290O15078 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP290O15078 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP290O15078 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP290O15078 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP290O15078 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP290O15078 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP290O15078 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP290O15078 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP290O15078 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP290O15078 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP290O15078 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP290O15078 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP290O15078 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP290O15078 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP290O15078 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP290O15078 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP290O15078 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP290O15078 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP290O15078 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP290O15078 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP290O15078 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP290O15078 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP290O15078 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP290O15078 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP290O15078 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP290O15078 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP290O15078 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP290O15078 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP290O15078 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP290O15078 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP290O15078 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP290O15078 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP290O15078 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP290O15078 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP290O15078 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP290O15078 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP290O15078 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP290O15078 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP290O15078 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP290O15078 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP290O15078 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP290O15078 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP290O15078 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP290O15078 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP290O15078 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP290O15078 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP290O15078 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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