Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBN2O15020 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTBN2O15020 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTBN2O15020 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms