Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASKO14936 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASKO14936 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASKO14936 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASKO14936 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASKO14936 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CASKO14936 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASKO14936 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASKO14936 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASKO14936 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASKO14936 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASKO14936 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASKO14936 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASKO14936 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASKO14936 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASKO14936 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASKO14936 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASKO14936 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASKO14936 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASKO14936 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASKO14936 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASKO14936 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASKO14936 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASKO14936 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASKO14936 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASKO14936 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASKO14936 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CASKO14936 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASKO14936 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASKO14936 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASKO14936 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASKO14936 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASKO14936 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASKO14936 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASKO14936 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASKO14936 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASKO14936 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASKO14936 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CASKO14936 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CASKO14936 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CASKO14936 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASKO14936 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASKO14936 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms