Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F3O00716 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F3O00716 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F3O00716 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F3O00716 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F3O00716 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F3O00716 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F3O00716 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F3O00716 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F3O00716 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F3O00716 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F3O00716 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F3O00716 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F3O00716 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F3O00716 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F3O00716 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F3O00716 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F3O00716 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F3O00716 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F3O00716 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
E2F3O00716 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F3O00716 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F3O00716 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F3O00716 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F3O00716 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F3O00716 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F3O00716 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F3O00716 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F3O00716 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F3O00716 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F3O00716 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F3O00716 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F3O00716 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F3O00716 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F3O00716 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F3O00716 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F3O00716 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F3O00716 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F3O00716 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F3O00716 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F3O00716 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F3O00716 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F3O00716 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F3O00716 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F3O00716 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F3O00716 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F3O00716 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F3O00716 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F3O00716 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F3O00716 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F3O00716 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F3O00716 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F3O00716 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F3O00716 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F3O00716 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F3O00716 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F3O00716 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F3O00716 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F3O00716 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F3O00716 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F3O00716 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F3O00716 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms