Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CDO00329 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms