Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFRSF10AO00220 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF10AO00220 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10AO00220 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms