Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNAP23O00161 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP23O00161 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms