Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPSO00116 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPSO00116 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPSO00116 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPSO00116 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPSO00116 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPSO00116 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPSO00116 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPSO00116 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPSO00116 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPSO00116 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPSO00116 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPSO00116 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPSO00116 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPSO00116 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGPSO00116 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPSO00116 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPSO00116 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPSO00116 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPSO00116 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPSO00116 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPSO00116 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPSO00116 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPSO00116 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPSO00116 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGPSO00116 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPSO00116 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPSO00116 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPSO00116 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPSO00116 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPSO00116 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPSO00116 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPSO00116 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPSO00116 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPSO00116 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPSO00116 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPSO00116 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGPSO00116 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPSO00116 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPSO00116 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPSO00116 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPSO00116 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPSO00116 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPSO00116 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPSO00116 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGPSO00116 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPSO00116 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPSO00116 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPSO00116 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPSO00116 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGPSO00116 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPSO00116 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPSO00116 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPSO00116 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPSO00116 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPSO00116 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPSO00116 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPSO00116 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGPSO00116 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPSO00116 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPSO00116 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPSO00116 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPSO00116 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPSO00116 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPSO00116 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPSO00116 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPSO00116 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGPSO00116 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPSO00116 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPSO00116 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPSO00116 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPSO00116 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPSO00116 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPSO00116 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPSO00116 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPSO00116 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPSO00116 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPSO00116 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPSO00116 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPSO00116 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPSO00116 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPSO00116 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPSO00116 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPSO00116 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPSO00116 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPSO00116 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPSO00116 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPSO00116 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPSO00116 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPSO00116 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPSO00116 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPSO00116 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPSO00116 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPSO00116 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPSO00116 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPSO00116 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPSO00116 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPSO00116 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPSO00116 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPSO00116 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms