Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOC4-APOC2K7ER74 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOC4-APOC2K7ER74 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms