Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
J3KT08 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
J3KT08 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
J3KT08 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
J3KT08 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
J3KT08 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
J3KT08 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
J3KT08 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
J3KT08 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms