Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
H7C1D1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
H7C1D1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1D1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1D1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1D1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1D1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1D1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1D1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1D1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1D1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1D1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C1D1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1D1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1D1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1D1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1D1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1D1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1D1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1D1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C1D1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1D1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1D1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1D1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1D1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1D1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1D1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1D1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1D1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1D1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1D1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1D1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H7C1D1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1D1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1D1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1D1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.57■■■□□ 2
H7C1D1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1D1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
H7C1D1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1D1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1D1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1D1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.56■■■□□ 2
H7C1D1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1D1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1D1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H7C1D1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1D1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.55■■■□□ 2
H7C1D1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1D1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1D1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1D1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1D1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.55■■■□□ 2
H7C1D1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1D1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C1D1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1D1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1D1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1D1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1D1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1D1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1D1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1D1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1D1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.54■■■□□ 2
H7C1D1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
H7C1D1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1D1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1D1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1D1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1D1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1D1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1D1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.52■■■□□ 2
H7C1D1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1D1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1D1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1D1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1D1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1D1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1D1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
H7C1D1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1D1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1D1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1D1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1D1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1D1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1D1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1D1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1D1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1D1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1D1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1D1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1D1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1D1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1D1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1D1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1D1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1D1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1D1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1D1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H7C1D1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
H7C1D1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms