Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NPIPB8E9PQR5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms