Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PATL2C9JE40 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms