Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SRRM5B3KS81 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRM5B3KS81 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms