Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNL1A8MU46 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNL1A8MU46 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms