Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms