Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN0

OTOL1, Otolin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOL1A6NHN0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTOL1A6NHN0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOL1A6NHN0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms