Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN8

Uncharacterized protein ENSP00000372125, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NCN8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NCN8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NCN8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NCN8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NCN8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NCN8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NCN8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NCN8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NCN8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NCN8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NCN8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NCN8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
A6NCN8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NCN8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NCN8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NCN8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NCN8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NCN8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NCN8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NCN8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NCN8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NCN8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NCN8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NCN8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NCN8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NCN8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NCN8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NCN8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NCN8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NCN8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NCN8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NCN8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NCN8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NCN8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NCN8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NCN8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NCN8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NCN8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NCN8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NCN8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NCN8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NCN8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NCN8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NCN8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NCN8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NCN8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NCN8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NCN8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NCN8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NCN8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NCN8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NCN8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NCN8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NCN8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NCN8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NCN8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NCN8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NCN8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NCN8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NCN8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NCN8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NCN8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NCN8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NCN8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NCN8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NCN8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NCN8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A6NCN8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NCN8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NCN8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NCN8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NCN8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NCN8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NCN8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NCN8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NCN8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NCN8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NCN8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NCN8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NCN8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NCN8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NCN8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NCN8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NCN8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NCN8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NCN8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NCN8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NCN8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms