Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GMNCA6NCL1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms