Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL33A6NCF5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms