Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSDA5PKW4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms