Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms