Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms