Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms