Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms