Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms