Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms