Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.3 ms